Der in TwinCAT 3 integrierte Safety-Editor erlaubt die Erstellung einer Sicherheitsapplikation in einer freigrafischen Umgebung. Die gewünschte Logik wird mit Hilfe eines FBD programmiert. Zur besseren Übersichtlichkeit kann die Anwendung in Netzwerken organisiert werden. Als Elemente der Logik können die bereits von den Logic-Komponenten bekannten Funktionsbausteine genutzt werden (digitale Funktionsbausteine für EL69xx; zusätzlich analoge Funktionsbausteine für EL6910, EJ6910, EK1960, AX8xxx-x1xx, AX8xxx-x2xx etc.).

Mit dem TwinSAFE Loader stellt das Beckhoff Engineering ein Kommandozeilentool zur Verfügung, das den Download und das Customizing von Safety-Projekten zur Laufzeit erlaubt. Dadurch ist die Verwendung der Entwicklungsumgebung TwinCAT 3 nicht zwingend erforderlich.

Der TwinCAT 3 Drive Manager 2 wird zur Inbetriebnahme des Multiachs-Servosystems AX8000, des Digital Kompakt Servoverstärkers AX5000, des dezentralen Servoantriebssystems AMP8000, der integrierten Servoantriebe AMI8100 oder der I/O-Komponenten EL72xx, EL74xx, EL70x7, ELM72xx, EP72xx und EJ72xx eingesetzt. Er ist wahlweise erhältlich als eine in die Automatisierungsplattform TwinCAT integrierte Version oder als Update-Version ohne TwinCAT. Der TwinCAT 3 Drive Manager 2 wird als Projekt in eine bestehende TwinCAT Solution eingefügt und ermöglicht eine separate Betrachtung von Einspeise- und Achsmodulen sowie Achskanälen.